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【教えて】生命情報科学・バイオインフォマティクス【ください。】

1名無しさん@おーぷん:2015/03/18(水)19:46:09 ID:n7h()
バイオインフォマティクスのスレッドです。
無いから立てました。
いろいろと教えてください。
2名無しさん@おーぷん :2015/03/18(水)19:48:17 ID:n7h()
まずは学生の時身に付けるべき、基礎知識と基本スキルを教えてください。
Linuxとかの基本コマンドは一通り使えるようになりました。
3名無しさん@おーぷん :2015/03/23(月)20:58:07 ID:f9x()
今日はPubMedで見つけてダウンロードしたペーパーを読んだ。
4名無しさん@おーぷん :2015/04/03(金)21:41:25 ID:ixo
プログラムはpythonとrubyどちらがいいでしょうか?
5名無しさん@おーぷん :2015/05/16(土)21:42:20 ID:7d1
このスレ
生命物理科学専攻の私、気になります!
6名無しさん@おーぷん :2015/05/18(月)19:12:36 ID:nTq
>>5
残念ながらopen2chには人がいないようです。
学生の入門的にはバイオインフォマティクス技術者認定試験を受けるのが一般的のようです。
7茨城縣護國神社 がとんでも :2015/06/02(火)21:26:53 ID:R8B
バイオインフォマティクス(英語:bioinformatics)、生命情報学は、生物学の分野のひとつで、遺伝子やタンパク質の構造といった生命が持っている「情報」と言えるものを
分析することで生命について調べる、といった分野である。
主な研究対象分野に、遺伝子予測、遺伝子機能予測、遺伝子分類、配列アラインメント、ゲノムアセンブリ、タンパク質構造アラインメント、タンパク質構造予測、遺伝子発現解析、
タンパク質間相互作用の予測、進化のモデリングなどがある。
近年多くの生物を対象に実施されているゲノムプロジェクトによって大量の情報が得られる一方、それらの情報から生物学的な意味を抽出することが困難であることが広く認識されるようになり、
バイオインフォマティクスの重要性が注目されている。
この一方遺伝子情報は核酸の配列というデジタル情報に近い性格を持っているために、コンピューターとの親和性が高いことが本分野の発展の理由になっている。
さらにマイクロアレイなどの網羅的な解析技術の発展に伴って、遺伝子発現のプロファイリング、クラスタリング、アノテーション(注釈)、大量のデータを視覚的に表現する手法などが重要になってきている。
こういった個別の遺伝子、タンパク質の解析等から更に一歩進み、生命を遺伝子やタンパク質のネットワークとして捉え、その総体をシステムとして理解しようとするシステム生物学という分野もある。
9名無しさん@おーぷん :2015/06/30(火)20:57:38 ID:XvV
>>8
バイオインフォマティクスのせいではありません。
ビックデータの解析方法の進歩のせいだと思います。

また次世代型シーケンサー?でかなりの遺伝子を読めるようになったのが大きいと思います。
10名無しさん@おーぷん :2015/07/23(木)13:39:28 ID:59V
>>4
この分野だとperlがメジャーかな
114 :2015/07/23(木)21:10:01 ID:sld
Perlですか?がんばります。
Rubyのほうが新しい感じがしますが、やっぱりPerlですよね。
ヨーロッパのほうではPythonがメジャーとか聞いたことあるのですがどうでしょうか?
13名無しさん@おーぷん :2015/07/29(水)20:13:33 ID:vxE
カエルさんの研究者?ということでしょうか?
14名無しさん@おーぷん :2015/07/30(木)19:18:08 ID:Sjj
blastの-outfmtのオプションでdescriptionsがでないので不思議だったが、
titleとかの引数をいれると記述がでました。
解説されているwebページが少なくて探すのに時間がかかりました。
修論がんばります。
15名無しさん@おーぷん :2015/08/01(土)02:56:45 ID:SCM
日本の大学のバイオインフォマティクスの研究室はどれくらいありますか?
研究内容とか知りたいです。
17名無しさん@おーぷん :2015/09/16(水)05:20:33 ID:Wyo
http://www.slideshare.net/sayamatcher/next-generation-life-science-bioinformatics

読んでいて勉強になったスライドです。

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